About this role
Wat bieden wij je? - -
- Waarom het Erasmus MC?
- Wat bieden wij je?
- Bioinformaticus neoantigeen-gebaseerde kankervaccins Word bioinformaticus in ons team en bouw mee aan de ontwikkeling van gepersonaliseerde kankervaccins voor de behandeling van patiënten met alvleesklierkanker
- Wetenschap en Onderzoek Binnen de afdeling Longgeneeskunde zijn wij op zoek naar een enthousiaste en gedreven bio-informaticus die ons team komt versterken bij de ontwikkeling van gepersonaliseerde neoantigeen peptide gebaseerde kankervaccins voor de behandeling van patiënten met alvleesklierkanker.
Je belangrijkste werkzaamheden bestaan uit
- Het ontwikkelen en onderhouden van een bio-informaticapijplijn voor de identificatie van neoantigenen.
- Het analyseren van next-generation sequencing-data (WES en RNA-seq) om tumorspecifieke mutaties te identificeren.
- Het implementeren en optimaliseren van machinelearningalgoritmen voor de voorspelling van neoantigenen.
- Het integreren van openbare en eigen datasets om de nauwkeurigheid van de pijplijn te verbeteren.
- Het samenwerken met onderzoekers die laboratoriumexperimenten uitvoeren om voorspelde neoantigenen te valideren.
- Het onderhouden en documenteren van computationele workflows om de reproduceerbaarheid van analyses te waarborgen.
- Het bijdragen aan wetenschappelijke publicaties en subsidieaanvragen.
Voor kandidaten die geïnteresseerd zijn in het behalen van een PhD, biedt deze functie mogelijk de gelegenheid om door te groeien naar een promotietraject. Dit is afhankelijk van je ambities en prestaties, de voortgang van het project en de beschikbaarheid van financiering. De onderzoeksgroep Neoantigen Peptide maakt deel uit van de onderzoeksgroep Solid Tumor Immunology Research Rotterdam (STIRR), die is ondergebracht bij de afdeling Longgeneeskunde. STIRR verricht fundamenteel, translationeel en klinisch onderzoek naar de voorwaarden voor een effectieve antitumorimmuniteit en de m...