About this role
Mission
Préparer et optimiser les bibliothèques d'ADN et d'ARN issues de carottes de glace en vue de leur séquençage, dans un contexte de faible biomasse.
Activités
Préparation des échantillons
Extraire et purifier l'ADN et ARN à partir de carottes de glace, en respectant des protocoles adaptés aux échantillons à faible biomasse.
Optimiser les méthodes de concentration et de purification pour maximiser la récupération d'ADN et d'ARN.
Construction des bibliothèques
Appliquer des techniques de PCR, clonage et génotypage pour préparer les échantillons avant séquençage.
Utiliser des méthodes de séquençage haut débit (ex : Illumina, Nanopore) et adapter les protocoles en fonction des spécificités des échantillons glaciaires.
Contrôle qualité
Réaliser des analyses par électrophorèse, cytométrie et microscopie pour évaluer la qualité et la quantité d'ADN et d'ARN.
Valider les bibliothèques avant séquençage (ex : vérification de la taille des fragments, absence de contaminants).
Collaboration et documentation
Travailler en étroite collaboration avec les chercheurs de l'équipe ICE3 pour ajuster les protocoles.
Documenter les procédures et les résultats dans un cahier de laboratoire ou un système de gestion des données.