About this role
Die Universität Rostock bietet Ihnen eine vielfältige, abwechslungsreiche und anspruchsvolle Tätigkeit in einer traditionsbewussten, aber dennoch innovativen, modernen und familienfreundlichen Hochschule in einer lebendigen Stadt am Meer.
An der Fakultät für Informatik und Elektrotechnik, Lehrstuhl für Systembiologie & Bioinformatik besetzen wir vorbehaltlich der Mittelzuweisung zum nächstmöglichen Zeitpunkt befristet für die Dauer des Projektes MICRO-NEST
bis 31.08.2031 die folgende Stelle:
Wissenschaftliche/r Mitarbeiter/in (m/w/d) -Systembiologie &Bioinformatik
MICRO-NEST ist ein „Horizont Europa“-Projekt, das die Wechselwirkungen zwischen Mikrobiom, Immunsystem und Gehirn im Zusammenhang mit der neurologischen Entwicklung und Autismus untersucht. An der Universität Rostock konzentriert sich das Projekt darauf, heterogene molekulare, bildgebende und klinische Datensätze in eine Autismus-Wissensdatenbank zu integrieren und
netzwerkbasierte sowie auf maschinellem Lernen basierende Ansätze anzuwenden, um personalisierte computergestützte Modelle zu entwickeln. Die daraus resultierenden Modelle sollen dazu dienen, Krankheitsmechanismen zu untersuchen und prädiktive Marker sowie potenzielle therapeutische Ansatzpunkte zu identifizieren
DAS SIND IHRE AUFGABEN
- Forschung auf dem Gebiet der Sytemmedizin
- Entwicklung von Methoden und Arbeitsabläufen zur Integration und Analyse heterogener biomedizinischer Daten
- Analyse und Integration von Transkriptom-, Bildgebungs- und anderen multimodalen biomedizinischen Datensätzen
- Aufbau, Pflege und Analyse biologischer netzwerkbasierter Methoden zur Identifizierung prädiktiver Marker und therapeutischer Zielstrukturen
- Integration biologischer Datenbanken, Signalweginformationen und externer Datenquellen in computergestützte Analysen
- Mitwirkung an der Entwicklung patientenspezifischer Computermodelle und des patientenpersonalisierten digitalen Zwillings für Autismus
- enge interdisziplinäre Zusammenarbeit und Koordination mit Partnern aus den Bereichen
- Klinik, Experiment und Datenanalyse
- Verfassen, Veröffentlichen und Präsentieren wissenschaftlicher Ergebnisse sowie Mitwirkung an der wissenschaftlichen Organisation des Projekts
DAMIT PASSEN SIE ZU UNS
- abgeschlossenes wissenschaftliches Hochschulstudium (Master, Diplom oder vergleichbarer Abschluss) in Systembiologie/Bioinformatik, Informatik, Biotechnologie, Biologie oder einer vergleichbaren Fachrichtung mit sehr gutem Ergebnis
- sehr gute Erfahrungen in der computergestützten Analyse von Transkriptomdaten oder anderen biomedizinischen Daten
- sehr gute Erfahrung in der Programmierung mit Python und/oder R
- großes Interesse an interdisziplinärer biomedizinischer Forschung
- fließende Englischkenntnisse in Wort und Schrift
- Fähigkeit, in interdisziplinären Teams zu arbeiten und effektiv mit Projektpartnern zu kommunizieren
- wünschenswert sind Erfahrung mit der Analyse biologischer Netzwerke, Signalwege oder der Zell-Zell-Kommunikation
- Kenntnisse in maschinellem Lernen und statistischen Methoden zur biomedizinischen Datenanalyse
- Erfahrung mit bildgebungsbasierten biologischen Daten und biologischen
- Datenbanken/APIs Erfahrung im FAIRDatenmanagement
- eine strukturierte, lösungsorientierte und proaktive Arbeitsweise sowie die Fähigkeit, wissenschaftliche Kooperationen aufzubauen und zu koordinieren
- die Fähigkeit, computergestützte Methoden kritisch zu bewerten und komplexe Ergebnisse gegenüber Kooperationspartnern mit unterschiedlichem wissenschaftliche Hintergrund klar zu vermitteln
WIR ALS ARBEITGEBER
Chancengleichheit ist uns wichtig. Bewerbungen geeigneter schwerbehinderter oder gleichgestellter
Menschen sind uns willkommen. Wir streben eine Erhöhung des Anteils von Frauen in Forschung und
Lehre an und bestärken deshalb einschlägig qualifizierte Frauen sich zu bewerben. Bewerbungen von
Menschen anderer Nationalitäten oder mit Migrationshintergrund begrüßen wir.
WIR BIETEN IHNEN
- Flexible Arbeitszeit
- 30 Tage Jahresurlaub
- Jahressonderzahlung/ Betriebliche Altersvorsorge
- Familienbüro
- Gesundheitsmanagement & Hochschulsport
- Welcome Center
- Weiterbildungsmöglichkeiten (IT, Sprachen, berufliche Weiterbildung)
- Mobiles Arbeiten
- Karriereberatung für Nachwuchswissenschaftler/innen
- Fahrradleasing
- Mitarbeiterparkplatz 24.12. & 31.12. arbeitsfrei
- Mensa - Mitarbeitendentarif Willkommenstag
- Möglichkeit zur Promotion
WEITERE HINWEISE
Die tarifliche Erfahrungsstufe legen wir unter Berücksichtigung Ihrer bisherigen Berufserfahrung
individuell fest. Sofern Sie diese Stelle in Teilzeit ausüben möchten, ist dies unter Berücksichtigung der dienstlichen
Werden Sie Teil des Teams Der Lehrstuhl für Systembiologie und Bioinformatik ist auf
computergestützte Systembiologie, unterschiedlichem wissenschaftlichem Hintergrund klar zu vermitteln