About this role
Wissen schaffen. Seit 1502: Die Martin-Luther-Universität Halle-Wittenberg (MLU) bietet ein breites Spektrum an akademischen Fächern in den Bereichen Geistes- und Sozialwissenschaften, Naturwissenschaften und Medizin. Die älteste und größte Universität Sachsen-Anhalts entstand 1817 durch den Zusammenschluss der Universität Wittenberg (gegründet 1502) mit der Friedrichs-Universität Halle (gegründet 1694). Heute hat die Universität 340 Professoren und 20.000 Studenten. Die Forschungsschwerpunkte der Universität liegen in den Bereichen Nano- und Lebenswissenschaften, Aufklärung, Gesellschaft und Kultur.An der Martin-Luther-Universität Halle-Wittenberg, Medizinische Fakultät, Universitätsklinik und Poliklinik für Innere Medizin I, ist ab dem nächstmöglichen Zeitpunkt die, auf bis zu 3 Jahre befristete, Stelle einer*einesWissenschaftlichen Mitarbeiters*in - Datenanalyse / Bioinformatik (m-w-d)in Vollzeit zu besetzen.Die Vergütung erfolgt je nach Aufgabenübertragung und Erfüllung der persönlichen Voraussetzungen bis zur Entgeltgruppe 13 TV-L.Unsere Arbeitsgruppe verfolgt das Ziel, personalisierte Prävention, Diagnose und Behandlung von Bauchspeicheldrüsenkrebs durch die Analyse von Patientenproben (Pankreas, Fettgewebe, Blut) mittels Single-Cell- und Spatial-Transcriptomics zu verbessern. Diese hochdimensionalen Analysen werden durch funktionelle Studien mit ex vivo Organoid-, Primärzell- und in vivo Mausmodellen ergänzt. Die Arbeit ist in das Pankreaszentrum Halle, das DFG-geförderte GRK2751 und das EFRE-mikroPank-Konsortium integriert. Unser Bioinformatik-Team betreut die gesamte Pipeline von der Datengenerierung bis zur klinischen Anwendung.Konzeption und Planung von Experimenten und DatenanalysenAnalyse von Next Generation Sequencing (NGS)-, Einzelzellsequenzierungs (scRNA-seq / snRNA-seq) und räumlichen Transkriptomik (spatial transcriptomics) DatenAuswertung und Dokumentation der ForschungsergebnisseSchreiben von R- und / oder Python-SkriptenEntwicklung und Optimierung von Analyse WorkflowsEtablierung neuer Daten-Analyse-MethodenProjektleitungBeteiligung an nationalen und internationalen KooperationenVorträge, SeminareVerfassen von begutachteten (peer reviewed) Publikationen und AnträgenBetreuung von Bachelor-, Master- und PhD StudierendenMitwirkung an Workshops und Lehrveranstaltungen gemäß LVVOMöglichkeit zur eigenen wissenschaftlichen Qualifizierung ist gegeben - HabilitationAbgeschlossenes wissenschaftliches Hochschulstudium (Master, Diplom) in einem Fach der Biowissenschaften wie Bioinformatik, Biologie, Biochemie, Humanmedizin oder einer vergleichbaren FachrichtungErfolgreich abgeschlossene Promotion (PhD, Dr. rer. nat., Dr. med. oder vergleichbar)Fortgeschrittene Kenntnisse in R und / oder PythonUmfassende Kenntnisse und mehrjährige Erfahrungen in der Analyse von NGS-, scRNA-seq- und / oder räumlichen Transkriptomikdaten, mathematischer Modellierung dynamischer biologischer Prozesse und statistischer Analyse biomedizinischer FragestellungenSicherer Umgang mit Linux UmgebungenMehrjährige Erfahrung in der Erforschung menschlicher Krankheiten, vorzugsweise Pankreaskrebs- und / oder Adipositas-ForschungStarkes Interesse an translationaler KrebsforschungErfahrung bei der Erstellung wissenschaftlicher Publikationen und DrittmittelanträgeErfahrung in der LehreSehr gute Deutschkenntnisse in Wort und SchriftSehr gute Englischkenntnisse in Wort und SchriftSehr gute didaktische FähigkeitenAnalytisches und problemorientiertes DenkenStrukturierte und sorgfältige ArbeitsweiseFähigkeit zur Arbeit in einem interdisziplinären Teamenge Zusammenarbeit mit experimentellen Gruppen, Kliniker*innen in den Konsortien IncuPanc / mikroPank,Zugang zu hochwertigen, Patienten und Tiermodel Multi-Omics-Datensätzen und zu Biobank Material,interessante und abwechslungsreiche Tätigkeiten mit Gestaltungsspielraum bei der größten Arbeitgeberin der Region,die Möglich...Homeoffice:Umfang: Nach Vereinbarung