About this role
Description :
Dans le cadre des activités de recherche de l'équipe de Homaira NAWABI « Du développement à la réparation» de l'unité de rechercche Grenoble Instititut Neurosciences, le/la bioinformaticien(ne) participera à un projet visant à analyser et intégrer des données biologiques à haut débit (single nuclei RNA seq ; analyses haut débits déjà publiés, données de protéomique) pour mieux comprendre les mécanismes biologiques mis en jeu lors de la formation de circuits neuronaux
Activités principales :
* Analyse de données biologiques : traitement, nettoyage et normalisation de données issues de cytométrie en flux et de plateformes protéomiques * Intégration multi-omique : mise en oeuvre d'approches d'intégration de données hétérogènes (biologiques et cliniques). * Analyse statistique et modélisation : analyses exploratoires, analyses multivariées,clustering, réduction de dimension, identification de signatures biologiques et découverte de biomarqueurs. * Développement de pipelines reproductibles : création et maintenance de workflows d'analyse sous R/Python * Interaction avec l'équipe : échanges réguliers avec biologistes, participation aux réunions de projet. * Rédaction et communication scientifique : préparation de figures, rapports, documentation, contributions aux publications. * Gestion des données : organisation, documentation et archivage des données selon les bonnes pratiques (FAIR, traçabilité).
Profil recherché : FORMATION
* Diplôme de niveau BAC+5
CONNAISSANCES
* Maîtrise des concepts et méthodes en BIOINFORMATIQUE, BIOSTATISTIQUES et analyse de données omiques. * Solides compétences en R ET/OU PYTHON (ou autre langage de programmation adapté à l'analyse de données). * Expertise en TRANSCRIPTOMIQUE et/ou PROTÉOMIQUE, avec une bonne connaissance des deux domaines appréciée. * Connaissance des approches et méthodes d'INTÉGRATION DE DONNÉES MULTI-OMIQUES. * Bonne compréhension des principes de la BIOLOGIE DES SYSTÈMES ; des connaissances en NEUROSCIENCES seraient un atout. * Maîtrise des principes FAIR et des bonnes pratiques de gestion et de valorisation des données scientifiques.
COMPÉTENCES TECHNIQUES
* Analyser et interpréter des jeux de données biologiques complexes et volumineux. * Développer, automatiser et documenter des pipelines d'analyse reproductibles. * Mettre en œuvre des méthodes statistiques avancées adaptées aux données omiques. * Produire des visualisations pertinentes et communiquer efficacement des résultats complexes. * Rédiger des protocoles, rapports d'analyse, documentations techniques et publications scientifiques.
QUALITÉS ATTENDUES
* Rigueur scientifique et sens de la qualité. * Esprit d'analyse et de synthèse. * Autonomie et capacité à piloter des projets d'analyse de données. * Aptitude à travailler au sein d'équipes pluridisciplinaires associant biologistes, cliniciens et data scientists. * Excellentes qualités relationnelles et de communication, à l'écrit comme à l'oral. * Sens de l'organisation, gestion des priorités et capacité d'adaptation. * Force de proposition et aptitude à anticiper et résoudre les problématiques techniques ou scientifiques.
EXPÉRIENCE SOUHAITÉE
* Expérience significative en analyse de données omiques (transcriptomique, protéomique, cytométrie, etc.). * Expérience en INTÉGRATION MULTI-OMIQUE ou en DATA SCIENCE APPLIQUÉE AUX SCIENCES BIOMÉDICALES. * Expérience du travail dans un environnement de recherche académique ou en collaboration avec des équipes biologiques et/ou cliniques. * Une expérience dans le domaine des NEUROSCIENCES