About this role
Nacionālais pētniecības un inovāciju institūts (NIRI), reģ. nr. 40900041720, aicina pieteikties uz vakanto pētnieka amatu (pēcdoktorantūras pētnieks antimikrobiālās rezistences genomikā un mikroorganismu ekoloģijā). Nacionālais pētniecības un inovāciju institūts (NIRI) aicina pievienoties ambiciozu un sadarbībai atvērtu pēcdoktorantūras pētnieci/pētnieku starpdisciplināram pētniecības projektam, kas veltīts antimikrobiālās rezistences (AMR) izpētei lopkopības sistēmās, balstoties uz “Vienas veselības” pieeju. Projekts apvieno mikroorganismu ekoloģiju, metagenomiku, pilna genoma sekvenēšanu un vides monitoringu, lai izprastu mehānismus, kas veicina AMR rašanos un izplatību lauksaimniecības un vides ekosistēmās. Veiksmīgais kandidāts piedalīsies modernākajos genomiskās uzraudzības pētījumos un cieši sadarbosies ar mikrobiologiem, veterinārārstiem, bioinformātiķiem un vides zinātniekiem. Pienākumi Metagenomisko un pilna genoma sekvenēšanas datu analīze Baktēriju genomu montāža, anotēšana un salīdzinošā genomika Hibrīdo asambleju darbplūsmu īstenošana, izmantojot Illumina un Oxford Nanopore sekvenēšanas datus Antimikrobiālās rezistences gēnu, virulences faktoru un mobiloma izpēte Genomisko, ekoloģisko un vides datu integrēšana Bioinformātikas analīzes darbplūsmu izstrāde un optimizācija metagenomiskajai uzraudzībai Doktorantu un jaunāko pētnieku mentoringa nodrošināšana Zinātnisko publikāciju, ziņojumu un konferences prezentāciju sagatavošana Dalība projektu rezultātu izpildē un sadarbības pētniecības aktivitātēs Prasības Doktora grāds mikroorganismu ekoloģijā, mikrobioloģijā, genomikā, bioinformātikā, skaitļošan